| BİRİM İÇ KONTROL SORUMLUSU | |
| Birim Adı | Birim Sorumlusu |
| Tıp Fakültesi | Dr. Öğr. Üyesi Mehmet Ali GÜL |
| Eğitim Fakültesi | Dr.Öğr.Üyesi Burcu AKBULUT BİLİCİ |
| İlahiyat Fakültesi | Fatma ARSLAN |
| Mimarlık Fakültesi | Doç Dr. Burçin Şenol ŞEKER |
| Teknoloji Fakültesi | Hasan ÖKSÜM |
| Fen-Edebiyat Fakültesi | Berna GÖRKEM |
| Sağlık Bilimleri Fakültesi | Eyüp KÖKREK |
| Merzifon İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi | Öğr. Gör. İnan AKDAĞ |
| Sosyal Bilimler Enstitüsü | Recep ÇALIŞ |
| Fen Bilimleri Enstitüsü | Recep ÇALIŞ |
| Sağlık Bilimleri Enstitüsü | Recep ÇALIŞ |
| Yabancı Diller Yüksekokulu | Erkan ARMUT |
| Tasarım Meslek Yüksekokulu | Öğr. Gör. Hüseyin Onur ERDEM |
| Suluova Meslek Yüksekokulu | Yunus Emre TEMUR |
| Merzifon Meslek Yüksekokulu | Ümit KURUGÖL |
| Amasya Sosyal Bilimler Meslek Yüksekokulu | Öğr. Gör. Kenan PALA |
| Amasya Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu | Dr. Öğr. Üyesi Hasan Hüseyin ÖKTEN |
| Taşova Yüksel Akın Meslek Yüksekokulu | Muammer GÖKÇE |
| Gümüşhacıköy Hasan Duman Meslek Yüksekokulu | Niyazi CULUK |
| Sabuncuoğlu Şerefeddin Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu | Öğr. Gör.Ertuğrul Deniz KÖSE |
| Mer.Ar.Uy.Lab.Uyg.ve Araştırma Merkezi | Öğr. Gör.Ersin DEMİR |
| Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi | Dr. Öğr. Üyesi Mehmet KARA |
| Erasmus+ Kurum Koordinatörlüğü | Fatih ÇEMÇEM |
| Farabi Kurum Koordinatörlüğü | Nazmiye Didem LAP |
| Mevlana Kurum Koordinatörlüğü | Muharrem ÇELİK |
| Özel Kalem (Rektörlük) | Elif Özge PEKŞEN |
| Özel Kalem (Genel Sekreterlik) | Dilek BÜYÜKBAYRAKTAR |
| İdari ve Mali İşler Daire Başkanlığı | Kadriye GÖK |
| Personel Daire Başkanlığı | Gözde İKİZ |
| Kütüphane ve Dokümantasyon Daire Başkanlığı | Makbule TOLAN AYDIN |
| Sağlık, Kültür ve Spor Daire Başkanlığı | Şükrü ÖZER |
| Bilgi İşlem Daire Başkanlığı | Turgay ŞAHİN |
| Yapı İşleri ve Teknik Daire Başkanılğı | Şevkat Nur YILDIZ |
| Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı | Filiz DENİZ |
| Strateji Geliştirme Daire Başkanlığı | Özlem YILDIZ |
| Hukuk Müşavirliği | Tuba ÇETİN |
| Basın Yayın ve Halkla İlişkiler Müdürlüğü | Hakan DAVULCU |
| Döner Sermaye İşletme Müdürlüğü | Songül BAL |
| BAP | Songül BAL |